第一、資金緊張、人手不足，網站運營難以為繼
由于得到的支持逐漸減少，資金和人員成為近年來制約明慧網運營的主要因素。在這次法會的問答中，明慧網的弟子向自己的主子李洪志申訴了一籮筐的困難：一是人員流失嚴重，“因為十年全職做、沒有收入和常人職業(yè)，漸漸都去找工作了?！薄啊骰劢裹c’電視欄目曾經在將真相中起到了很好的作用，但后來由于人員問題停了?！倍羌夹g人員短缺，“由于目前翻譯人手的限制，法文圓明網和法文明慧網共享翻譯文章，所以兩個網站的內容非常相似”；三是資金嚴重緊缺又不敢擅自行動，只好向“教主”請示“目前形勢下向常人申請基金，是否可行？”
對于這些困難，李洪志的解決方式多少讓弟子們有些失望，“怎么樣解決這些問題，那還得靠你們去努力”，把球又踢回給了明慧網的弟子。但是師父可以提供一些“精神食糧”：“明慧網辦好了，這就是你們做的一件最偉大的救人工作”，就這么一句空頭支票把明慧網的弟子給打發(fā)了，看來師父的法力也是有限的。臨到最后李洪志終于撐不住說了一句實話“其實那，國外這邊人手很有限”，原來師父和明慧網弟子的難題是一樣的。
第二、做網站的弟子毫無底氣，自我懷疑嚴重
作為法輪功喉舌的明慧網在蒙蔽和蠱惑法輪功弟子的同時卻無法說服自己，甚至對自己的工作產生了懷疑。有的明慧網弟子自陳“我們覺得每天很累，工作也不少做，但在救人效果方面卻得不到明顯改善，好像被什么東西擋住了”。另外一些弟子則認為“中文網站的文字水平一直提高不上去，造成常人（特別是知識分子）中的可讀性不夠好?！笔聦嵣?，問題的關鍵不在于文字水平不高，如果天天說謊，就是大文豪也會懷疑自己的文字能力。這種懷疑演變到極點的時候，有的明慧網的弟子甚至對明慧網存在的必要性產生了懷疑：“我們覺得明慧網上關于海外的內容力度需要充實起來，想找回原來的同修，可不可以跟他們說明慧網海外工作對救渡眾生還是很重要？如果他們不確認明慧的重要性的話，就比較難鼓勵他們在明慧網海外報道方面下功夫”，連明慧網是不是還發(fā)揮著“重要的作用”都要戰(zhàn)戰(zhàn)兢兢地去請示師父，向別的“同修”求得對自己的肯定，這樣的網站還談何發(fā)展呢？
第三、法輪功媒體間內耗加劇，明慧網的前景堪憂
法輪功內部高層爭奪的加劇和人員的分化，內耗直接削弱了明慧網的實力。這主要表現(xiàn)在：一是拉人，有弟子向李洪志控訴“明慧工作要求安全、低調，海外人員常常感到環(huán)境壓力，有的感覺難以施展和協(xié)調。其他項目從明慧拉人時甚至直接說‘都什么時候了還做明慧……’”；二是搭便車，搶奪資源，有弟子提到“德語的圓明網因為人手缺乏，想和德文明慧做，分享資源”；更讓明慧網不能容忍的是有的作者也開始要挾明慧網“有的大陸同修投稿說若明慧網不登就給大紀元”。對于這些問題，李洪志只能四面安撫，既不能傷了明慧網的心，又不能寒了其他媒體工具的心，事實上這種爭奪根源在法輪功內部的爭奪，這個問題解決不了，明慧網面臨的沖擊會越來越多。
第四、李洪志對明慧網并不完全滿意，來自“教主”的支持已大打折扣
李洪志對明慧網并不十分滿意。雖然在明慧網建立十周年之際，李洪志自然要給明慧網的弟子打氣鼓勁，稱贊明慧網“在大法弟子辦的網站中，是一個關鍵的網站”，但是也沒有忘記敲打敲打自己的弟子“明慧網的特殊性也使一些大法弟子比較封閉，所以和其他學員的交流也比較少一些，這就使他們更艱難”，看來明慧網的工作還沒完全到位，使一些學員“更艱難”，李教主多少是有些不滿的。李洪志對明慧網的信任也是有限的，當有弟子問“新唐人電視臺制作的觀眾反饋節(jié)目，目前明慧也在轉載。我們能不能稍微大量制作、作為推廣神韻的材料之一”的時候，李洪志的回答很干脆“這個在新唐人電視臺和其它媒體可以大做，明慧就不要大量做，明慧不要偏離角度”，明著是為了防止明慧網“偏離角度”，實際的目的恐怕是為了防止明慧網同其他宣傳工具相互爭利、一家坐大、難以控制吧。其實這種不信任更體現(xiàn)出了李洪志的一種隱憂，自從所謂的“唐奇”特務出現(xiàn)以后，李洪志就特別加大了對各個媒體工具的監(jiān)控，并制造矛盾讓他們相互牽制，不再完全信任任何一個媒體，防止這些媒體一旦反水會把自己出賣得山窮水盡，這也使得李洪志的明慧網的支持多少有些若即若離。
明慧網建立十周年，李洪志本來想借法會之機為明慧網的弟子鼓勁打氣，卻不想借他和弟子之口暴露了法輪功內部矛盾不斷、明慧網困難重重，借用李洪志的說法，明慧網的確是一個窗口，但它不止散發(fā)出歪理邪說，也讓人們通過這個窗口更加清楚的認識到法輪功的頹廢和虛偽。