1998年10月，蔡愛珠被查出患有淋巴結(jié)核病，醫(yī)院專家根據(jù)她的早期病情采取了最佳的治療方案，每天服以中西藥，并合理膳食，注意休息。由于精心治療，方法得當(dāng)，病情轉(zhuǎn)而穩(wěn)定，并有所好轉(zhuǎn)。
1999年5月，渴望盡快康復(fù)的她經(jīng)別人介紹練上了法輪功，并一度達(dá)到了癡迷的程度。她對法輪功宣揚(yáng)的“練功就能治病，修煉不許吃藥”的“消業(yè)”邪說深信不疑，害怕打針吃藥把“業(yè)力”壓回去，不能真正的消除，反而病情惡化，或者添加新病。所以在李洪志的蠱惑下，蔡愛珠停止了治療，堅持不就醫(yī)，不吃藥，還寄希望于通過修煉法輪功來消去“病業(yè)”。
蔡愛珠因為癡迷法輪功致使病情延誤，逐漸加重，患病中后期，出現(xiàn)盜汗、疲倦、厭食、消瘦等全身癥狀。2001年1月10日她像往常一樣繼續(xù)在家練功時，病情出現(xiàn)惡化，全身哆嗦并伴有吐血，當(dāng)場暈倒在地。當(dāng)家人發(fā)現(xiàn)送到醫(yī)院后，蔡愛珠已經(jīng)停止了呼吸，經(jīng)診斷為淋巴結(jié)核感染并發(fā)肺結(jié)核，因貽誤治病時機(jī)最終過早地離開了人世，時年38歲。